مثَّل محمد حسنين هيكل ذاكرة حقيقية للوطن، وترك رصيدا هائلا من المؤلفات الرصينة والقيمة التي أصبحت ذخيرة صحفية وثقافية للأجيال المقبلة، وثق من خلالها بتفرد كامل، تاريخ مصر والمنطقة.
كتبه العديدة كانت تعكس غزارة اطلاعه ومتابعاته لأحداث الزمن الذي عاشه وعلاقاته بصناع السياسة في بلدان مؤثرة بالشرق الأوسط وأوروبا وأمريكا والاتحاد السوفييتي سابقا.
ففي عام 1951 صدر له كتاب "إيران فوق بركان"، يروي فيه تفاصيل رحلة شهر كامل إلى إيران في حقبة مفصلية من تاريخها الحديث.
اشتهر محمد حسنين هيكل بمقالات "بصراحة" والتي كانت الأشهر في الصحافة المصرية، وكان هذا العنوان (بصراحة) أشهر مساحة مخصصة لمقال صحفي، ليس في مصر وحدها بل في العالم العربي كله، حيث كان هيكل الشهير بالجورنالجي والصحفي الأول في العهد الناصري، يكتب مقاله الأسبوعي في الأهرام تحت هذا العنوان.
وصدر له أول كتاب: إيران فوق بركان، بعد رحلة إلى إيران استغرقت شهراً كاملاً، عام 1951، وفي 1952 كان يلازم جمال عبدالناصر والحياة بالقرب منه ومتابعته على المسرح ووراء كواليسه بغير انقطاع، وسنوات حوار لم يتوقف معه في كل مكان.
وفي 1953 صدر للرئيس جمال عبدالناصر: فلسفة الثورة (كتاب)، الذي قام هيكل بتحريره.
كما صدرت له العديد من الكتب والمؤلفات وأبرزها: "كتاب العقد النفسية التي تحكم الشرق الأوسط، وأكتوبر 73 السلاح والسياسة، اتفاق غزة - أريحا أولا السلام المحاصر بين حقائق اللحظة وحقائق التاريخ، أقباط مصر ليسوا أقلية رسالة إلى رئيس تحرير جريدة الوفد، مصر والقرن الواحد والعشرون - ورقة في حوار، 1995 باب مصر إلى القرن الواحد والعشرين، أزمة العرب ومستقبلهم، المفاوضات السرية بين العرب وإسرائيل - الأسطورة والإمبراطورية والدولة اليهودية، عواصف الحرب وعواصف السلام، المفاوضات السرية بين العرب وإسرائيل سلام الأوهام أوسلو - ما قبلها وما بعدها".
كما صدر له أيضا: "المقالات اليابانية، الخليج العربي.. مكشوف تداعيات تفجيرات نووية في شبه القارة الهندية، العروش والجيوش كذلك انفجر الصراع في فلسطين قراءة في يوميات الحرب، بصراحة: أكثر من 700 مقال من يناير 1957 - يونيو 1990 (5 مجلدات من القطع الكبير)، حرب من نوع جديد، العروش والجيوش 2 - أزمة العروش وصدمة الجيوش قراءة متصلة في يوميات الحرب (فلسطين 1948)، كلام في السياسة قضايا ورجال: وجهات نظر (مع بدايات القرن الواحد والعشرين).
بالإضافة إلى "كلام في السياسة. عام من الأزمات! 2000 - 2001، كلام في السياسة نهايات طرق: العربي التائه 2001، كلام في السياسة الزمن الأمريكي: من نيويورك إلى كابول، سقوط نظام، لماذا كانت ثورة يوليو 1952 لازمة؟ الإمبراطورية الأمريكية والإغارة على العراق، استئذان في الانصراف رجاء ودعاء.. وتقرير ختامي، المقالات المحجوبة (نشرت في جريدة المصري اليوم)، خريف الغضب: قصة بداية ونهاية عصر أنور السادات".
ومن بين مؤلفاته: "مدافع آية الله، قصة إيران والثورة، لمصر لا لعبدالناصر، عند مفترق الطرق، حرب أكتوبر ماذا حصل فيها وماذا حصل بعدها، مبارك وزمانه من المنصة إلى الميدان".